我国可以作为能源利用的生物质资源主要以秸秆为主，林业加工剩余物的比例相对较小。秸秆的收集和运输是将田间的废弃桔秆采用较为经济的收集方式和设备进行收集并通过运输工具运送至秸秆加工及利用场所，以达到秸秆转化利用的目的。由于农作物秸秆普遍存在着松散、质轻以及分散、季节性强等特点，秸秆的收集和运输成本往往在秸秆能源化利用经济链条中占据较大的份额。

　　将粮食收获后的田间废弃桔秆进行收集，然后将其运送至秸秆加工或利用场所，条件允许也可以进行适当的晾晒、粉碎、打捆等处理以便于运输，甚至可以进行田间压块处理，然后直接运送至秸秆利用场所储存或直接利用。秸秆预处理可根据桔秆种类和过程经济性的不同选择适宜的方式，一般玉米秸秆、小麦秸秆、稻草等软质农作物秸秆在田间直接将其搞成高密度的捆后再进行运输，而棉花秸秆、大豆秸秆等硬质秸秆则一般可将其粉碎后再进行运输。将秸秆进行田间直接压块，可以人大提高运输和储存性能，直接运送至秸秆利用场所可以减少中间环节和成本，但是压块过程将显著提高秸秆的收购成本。田间秸秆收集过程可以由农户分散进行，也可以由专门收购商采用专业设备进行规模化的收集处理。

　　秸秆的运输应该综合考虑桔秆形式(散料、打捆、压块等)、运输方式(卡车畜力车)、运输距离以及单价运输成本等方面，确定合理的运输方式和收集半径，的收集和运输成本。

　　储存及加工主要是将田间运送来的秸歼进行处理，改变形状成质量，目的是提高秸秆的储存性能，延长存放时间，并将秸秆处理成利用过程所需要的形式。根据利用方式的不同，可进行切割、粉碎、打捆、压块成型、颗粒、氨化、堆肥等处理和加工.以便十后续的秸秆储存和利用。对于秸秆的处理目前开发的相关设备非常多，如打捆机、集捆机、切割机、粉碎机、压块机以及成型颗粒机等。生物质秸秆利用主要是将秸秆或是经过加工的秸秆进行适当的存储并加以利用。可作为育储、黄储饲料供牲畜食用，也可作为锅炉的燃料供居民采暖或是发电等。

　　秸秆的收集和运输应考虑当地的具体资源情况和种植利用实际，选择适当的方式，综合考虑秸秆的收集半径、收集周期、秸秆可获得量等相关因素，发挥出秸秆利用的经济效益。